Các phế phụ phẩm nông nghiệp như rơm, xác bã thực vật, rau củ quả, hay phân của động vật ăn cỏ đều có thể xử lý để làm thức ăn nuôi giun quế, thông qua các biện pháp xử lý các chủng vi sinh vật.